應用灸法時的配方，可根據疾病情況，人體素質和臟腑功能偏盛偏衰，以補偏救弊的原則，各有重點的擇優使用。現舉例配方如下：
①補中益氣艾灸養生方
【施灸方穴】百會、中脘、氣海、足三里、三陰交、太淵。
【方穴功用】益氣行血、通經活絡、補中益氣、昇陽舉陷、健脾和胃、溫中散寒、脾腎雙補、化水利濕、調和營衛。
【方穴主治】可作為一切亞健康艾灸養生保健的基礎施灸方穴，還可治療氣虛血瘀之中風、胃脘痛、腹脹、腹瀉、氣短、乏力、腰腿無力、浮腫等症。
②五臟俱補艾灸養生方
【施灸方穴】肺俞、心俞、膈俞、肝俞、脾俞、腎俞。
【方穴功用】補五臟、調氣血、安神定志、通經活絡。
【方穴主治】為背部膀胱經穴位，可用於強身健體、防治亞健康、體質衰弱。還可治療心悸氣短、腰酸乏力、中風後遺症及一切虛勞損傷。
③獨灸關元養生方
【施灸方穴】關元。
【方穴功用】補元益氣、溫腎健脾、補腎固脫、回陽救逆、溫中散寒、理氣止痛、補腎納氣、溫陽利水、補血調經、溫暖下元、補虛瀉實、延年保健。
【方穴主治】可用於陽痿早洩、夢遺滑精、遺尿癃閉、小便頻數、等泌尿生殖系統疾病，月經不調、閉經、痛經、崩漏帶下、產後出血等婦科常見病，腹脹腹痛、腹瀉痢疾、脫肛便秘等胃腸系統疾病，中風及一切虛勞損傷。關元還是人體重要補穴之一，女子可配合三陰交艾灸，男子可配合足三里艾灸。
關元作為常用的保健穴同足三里一樣重要。古有春灸氣海，秋灸關元，口生津液。若傷寒後，或中年久嗽不止，恐成虛勞，當灸關元三百壯。中年以上之人，腰腿關節作痛，乃腎氣虛憊，風邪所乘之症，灸關元三百壯。老人氣喘，乃腎虛氣不歸海，就關元二百壯。《類經圖翼》云：“關元主諸虛百損，……但是積冷虛乏，皆宜灸，多者千餘壯，少亦不下二三百壯。活人多亦。然虛頻次灸之，乃下兼三里，故曰：若要丹田安，三里不曾干。”宋代竇材說：“……真氣虛則人病，真氣脫則人死。保命之法，灼艾第一，丹藥第二，附子第三。人至三十，可三年一灸臍下三百壯；五十可二年一灸臍下五百壯；六十可一年一灸臍下三百壯；令人長生不老，余五十常灸關元五百壯……遂得老年健康。”由此可見，關元不但能夠治療諸虛百損，真陽欲脫等證，而且還可以保健延年。
④呼吸系統艾灸養生方： 風門、身柱、肺俞、足三里。
⑤心血管系統艾灸養生方：
高血壓：風門、曲池、足三里、陽陵泉。
冠心病：身柱、隙門、三陰交，也可以灸羶中穴。
⑥消化系統艾灸養生方：脾俞、胃俞、中脘、足三里、陽陵泉。
⑦神經系統艾灸養生方：大椎、身柱、 腎俞、足三里。
⑧泌尿生殖系統艾灸養生方：腎俞、關元、三陰交、足三里。
⑨一般強壯艾灸養生方：
此法自古盛行。作為平常健康灸，可取足三里、中脘、關元，或單灸足三里，也有很好的健身作用。施行健身灸法，一次十數分鐘時間多不過30分鐘，既無多大痛苦，又經濟節約。長期堅持施灸，可以提高身體素質，增進健康，其效果絕對不亞於服用膏方，是值得大力推廣的保健方法。